Kliininen neurofysiologia on lääketieteen erikoisala, jolla tehdään esimerkiksi aivosähkökäyrä-, uni-, vireystila- ja hermoratarekisteröintejä. Erikoistuville lääkäreille mittaustulosten tulkintaa opetetaan pitkälti potilastyön ohessa, työssä käytettävillä laitteilla ja ohjelmistoilla. Verkkoselainpohjainen sovellus tarjoaa helpon, tietoturvallisen ja edullisen tavan toteuttaa opetusta etänä. Samoja aineistoja on mahdollista hyödyntää sekä opetukseen että tieteelliseen tutkimukseen.
Itä-Suomen yliopiston väitöskirjatutkija Sampsa Lohi on kehittänyt avoimen lähdekoodin sovellusta, jolla voi tarkastella useita eri kliinisen neurofysiologian mittaustuloksia verkkoselaimella. Sovellus on ollut jo opetuskäytössä muun muassa Euroopan neurologiakatemian kongresseissa. Ilmainen sovellus esitellään nyt avoimessa Clinical Neurophysiology Practice -tiedelehdessä.
Helppoa saavutettavuutta verkkoselainsovelluksella
Verkkoselainsovellusten ehdottomiin vahvuuksiin kuuluu helppo saavutettavuus. Lohen kehittämä Epicurrents-niminen sovellus on käytettävissä millä tahansa laitteella, jolla voi käyttää Chromium-pohjaista verkkoselainta. Käyttö ei myöskään edellytä ylimääräisten ohjelmistojen asentamista, vaan sovellus toimii suoraan selaimessa. Koska sovellus tukee tiedostojen avaamista sekä käyttölaitteelta että verkossa, on myös pseudonymisoituja rekisteröintiaineistoja mahdollista jakaa ja tarkastella selaimen välityksellä toisiokäyttötarkoituksessa, kuten tieteellisessä tutkimuksessa. Verkkoselaimet mahdollistavat lisäksi käyttäjien luotettavan tunnistamisen, jos aineiston saavutettavuutta on tarpeen rajoittaa.
Edistyneitä työkaluja tieteelliseen tutkimukseen
JavaScript-pohjaisena sovelluksena Epicurrents ei ole erityisen suorituskykyinen vaativaan numeeriseen laskentaan. Tätä varten sovellus tarjoaa mahdollisuuden ajaa Python-koodia ja ONNX-pohjaisia koneoppimismalleja signaalidatan analysointiin. – Lisäominaisuudet kasvattavat myös keskusmuistin tarvetta ja ovatkin käytettävissä lähinnä pöytäkoneilla ja tehokkaammilla kannettavilla tietokoneilla, Lohi kertoo.
Avoimuus lisää luottamusta
Avoimen lähdekoodin periaatteiden mukaisesti Epicurrentsin lähdekoodi on paitsi avoimesti nähtävissä, myös vapaasti käytettävissä, muokattavissa ja jaettavissa eteenpäin. –Lähdekoodin avoimuus usein lisää luottamusta projektiin, ei pelkästään läpinäkyvyyden vuoksi, vaan myös projektin jatkuvuuden näkökulmasta. Se lisäksi mahdollistaa muiden aiheesta kiinnostuneiden osallistumisen ohjelmiston kehittämiseen, Lohi toteaa.
Lisätietoja:
Väitöskirjatutkija, neurologian ja kliinisen neurofysiologian erikoislääkäri Sampsa Lohi, Itä-Suomen yliopisto, [email protected]
Professori Petro Julkunen, Itä-Suomen yliopisto, teknillisen fysiikan laitos, [email protected]
Professori Reetta Kälviäinen, Itä-Suomen yliopisto, neurologia, [email protected]
Professori emeritus Esa Mervaala, Itä-Suomen yliopisto, kliininen neurofysiologia, [email protected]
Tutkimusartikkeli:
Sampsa Lohi, Petro Julkunen, Reetta Kälviäinen, Esa Mervaala. An open-source JavaScript clinical neurophysiology library for education and clinical research. Clinical Neurophysiology Practice; 2026. https://doi.org/10.1016/j.cnp.2026.02.001.
