Huippurahoitus sydänsairauksien genetiikan tutkimukseen

Amerikkalainen the National Human Genome Research Institute on myöntänyt huomattavan rahoituksen Cardio-Metabolic Sequencing Collaboration -projektille, jossa on mukana ainoastaan suomalaisia väestötutkimuksia.  Kuopiosta on mukana METSIM (METabolic Syndrome In Men) -tutkimus, jossa tutkittiin 10 197 Kuopiossa tai sen lähikunnissa asuvaa miestä.  Tutkimusta johtavat akatemiaprofessori Markku Laakso ja professori Johanna Kuusisto.  Muiden suomalaisten väestötutkimusten johtajana toimii professori Aarno Palotie Helsingin yliopistosta.

Koko tutkimusprojektin johtaja on professori Rick Wilson Washingtonin yliopistosta Saint Louisista Yhdysvalloista, jossa myös näytteiden sekvensointi tapahtuu.  Projektiin osallistuu myös tutkijoita kahdesta muusta amerikkalaisesta yliopistosta, Michiganin yliopistosta sekä Kalifornian yliopistosta Los Angelesissa (UCLA).Tutkimuksen pääpaino on sydän- ja verisuonisairauksiin liittyvien geenimuutosten selvittämisessä. 

Tutkimusprojektissa sekvensoidaan 5 000 METSIM -tutkimukseen osallistuneen henkilön kaikki eksonit eli geenien proteiineja koodava osa.  Tämänhetkinen eksomisekvensoinnin kustannus on noin 500 dollaria näytettä kohden, joten projekti sai noin 2,5 miljoonan dollarin rahoituksen.

– Suomessa tai Euroopassa ei ole mahdollisuuksia saada riittävää rahoitusta uuden sukupolven sekvensointitutkimuksiin suurissa väestötutkimuksissa niiden korkeiden kustannusten vuoksi, joten yhteistyö amerikkalaisten tutkijaryhmien kanssa on ainut mahdollisuus, toteaa akatemiaprofessori Laakso.

– On hienoa, että suomalaisia väestötutkimuksia arvostetaan maailmalla, sillä nyt alkaneeseen tutkimusprojektiin ei otettu mukaan tutkimusaineistoja muista maista.  Toinen tärkeä tekijä on se, että Suomi muodostaa geneettisen isolaatin, jonka vuoksi sydän- ja verisuonisairauksien genetiikan selvittäminen on helpointa juuri Suomessa, Laakso jatkaa .

Tutkimuksen ensimmäinen kokous pidettiin Saint Louisissa 20.1.2014.  Projekti toteutetaan vuoden 2014 aikana ja jatkorahoitusneuvottelut toisen vuoden rahoituksesta ovat jo käynnissä.  Jos jatkorahoitus järjestyy, niin siinä tapauksessa tehdään eksomisekvensointi lopuille noin 5 000 METSIM-tutkimuksen DNA-näytteelle tai vaihtoehtoisesti koko genomin sekvensointi noin tuhannelle näytteelle.

Lisätietoja: 

Akatemiaprofessori Markku Laakso, email: markku.laakso@kuh.fi; puh. 040-672 3338

Artikkelin kirjoitusvuosi: 2014

Takaisin tämän vuoden artikkeleihin